Perpustakaan Universitas Padjajaran
Pencarian Spesifik

Detail Cantuman

No image available for this title

Text  

Penentuan Afinitas Ikatan Senyawa Analog Estradiol Terhadap Human Estrogen Receptor Alpha Menggunakan Autodock, MOE, dan Molegro.

Estradiol, adalah senyawa analog steroid yang berpotensi aktif sebagai antikanker payudara. Afinitas estradiol juga ditemukan pada analognya, ...

  • CodeCallNoLokasiKetersediaan
    01021091000124Tersedia
  • Perpustakaan
    Fakultas Farmasi
    Judul Seri
    -
    No. Panggil
    2386
    Penerbit Fakultas Farmasi Universitas Padjadjaran : .,
    Deskripsi Fisik
    -
    Bahasa
    Indonesia
    ISBN/ISSN
    -
    Klasifikasi
    2386
    Tipe Isi
    -
    Tipe Media
    -
    Tipe Pembawa
    -
    Edisi
    NULL
    Subyek

    Info Detil Spesifik
    -
    Pernyataan Tanggungjawab
  • Estradiol, adalah senyawa analog steroid yang berpotensi aktif sebagai antikanker payudara. Afinitas estradiol juga ditemukan pada analognya, afinitasnya terhadap Human Estrogen Receptor Alpha (HER-?), yang diketahui berperan dalam perkembangan sel kanker payudara, dapat diprediksi dengan molecular docking, melalui parameter Konstanta Inhibisi (Ki). Pengetahuan mengenai afinitas analog estradiol penting untuk diteliti, sehingga dapat diketahui apakah senyawa analog estradiol memiliki ikatan yang kuat terhadap Human Estrogen Receptor Alpha, sehingga dapat dikembangkan sebagai obat antikanker payudara potensial yang baru. Penggunaan software komputasi seperti AutoDock, MOE, Molegro yang menggunakan algoritma yang berbeda pun penting untuk diteliti untuk melihat apakah ada perbedaan signifikan dalam penentuan harga Ki dari analog estradiol. Metode docking dengan AutoDock 3.0.5 disiapkan dengan melakukan docking ulang struktur kristal estradiol terhadap binding pocket semula dengan variasi grid dan run. Tiga puluh tiga analog estradiol yang di download dari Ki Data Bank (http://kibank.iis.u-tokyo.ac.jp) dan dari bindingdb (http://bindingdb.org) dimodelkan dengan metoda Molekular Mekanik dengan medan gaya MM+ sampai konvergensi 0.1kkal/mol oleh algoritma Polak-Ribiere. Docking dilakukan pada binding site chain A HER-? yang dideteksi oleh q-site finder untuk docking dengan AutoDock, deteksi binding site dilakukan dengan site finder untuk MOE, serta detect cavity untuk Molegro. Docking pada run 30 grid 40 dengan koordinat grid center (104.207, 13.918, 23.884) didapat sebagai model terbaik untuk docking senyawa analog estradiol pada AutoDock. Hasil docking menunjukkan bahwa afinitas ikatan analog estradiol yang ditentukan oleh AutoDock berkisar antara 1.93E-09 - 7.5E-10, MOE 4.6E-06- 1.56E-08 serta Molegro 0.02 - 2.1E-05. Hasil docking juga menunjukkan bahwa dengan ? = 5 % ada perbedaan secara nyata rata-rata Ki docking analog estradiol oleh AutoDock, MOE, dan Molegro.

    Kata Kunci : Estradiol, Human Estrogen Receptor Alpha, docking, Ki , AutoDock, MOE, Molegro

  • Tidak tersedia versi lain

  • Silakan login dahulu untuk melihat atau memberi komentar.


//

Informasi