• Bagikan:
• 
• 
• 
• 
• 
• 
• 

Text  

Eksplorasi Konformasi Dan Analisis Selektifitas Aptamer Anti-Fabp3 Untuk Deteksi Dini Penyakit Jantung Menggunakan Pendekatan In Silico

---

• Ketersediaan
• Informasi Detil
• Deskripsi
• Versi lain/terkait
• Komentar

• Code	CallNo	Lokasi	Ketersediaan
  MB70	MB70	Perpustakaan Sekolah Pascasarjana (2)	Tersedia

• Perpustakaan	Sekolah Pascasarjana
  Judul Seri	-
  No. Panggil	MB70
  Penerbit	: Bandung., 2025
  Deskripsi Fisik	-
  Bahasa	Indonesia
  ISBN/ISSN	-
  Klasifikasi	MB70
  Tipe Isi	-
  Tipe Media	-
  Tipe Pembawa	-
  Edisi	-
  Subyek	penyakit jantung
  Info Detil Spesifik	-
  Pernyataan Tanggungjawab	-

• ABSTRAK Diagnosis penyakit jantung biasanya baru diberikan kepada pasien ketika penyakit sudah melewati tahap awal. Oleh sebab itu, dibutuhkan metode diagnosis yang dapat secara dini mendeteksi penyakit jantung. FABP3 merupakan protein yang berpotensi sebagai biomarker unggul yang dapat mendiagnosis penyakit jantung pada 2-3 jam pertama. Penelitian terdahulu oleh Kakoti dan Goswami (2017) telah mengidentifikasi sekuen aptamer anti-FABP3 yang disebut N13, namun dengan sensitivitas yang masih terbatas dalam mendeteksi FABP3, diperlukan pemahaman lebih dalam tentang dinamika konformasi dan selektifitas dari aptamer tersebut untuk menjadi dasar pengaplikasiannya sebagai metode diagnosis dini penyakit jantung. Melalui penelitian ini, telah dilakukan analisis in silico terkait hal tersebut. Penelitian ini dilakukan dalam beberapa tahapan yaitu prediksi struktur aptamer N13 secara 2D dengan Mfold, prediksi struktur 3D dengan RNAComposer, analisis dinamika molekuler secara coarse-grain dengan SIRAH AMBER, serta analisis selektifitas menggunakan simulasi penambatan dengan HDOCK dan HADDOCK2.4. Hasil simulasi sepanjang 83 μs menunjukkan residu 1 hingga 50 menunjukkan pola konformasi yang konsisten dan stabil dalam simulasi pada rentang 40 μs, dengan penurunan nilai fluktuasi RMSD yang signifikan. Sebaliknya, residu 51 hingga 90 menunjukkan peningkatan pergerakan konformasi yang mengarah pada peningkatan nilai RMSD yang terjadi secara terus- menerus. Hasil simulasi penambatan konformasi N13 pada panjang simulasi 83 μs menunjukkan bahwa terdapat potensi pengenalan aptamer N13 terhadap beberapa biomarker lain, namun pengikatan yang terjadi mungkin lemah atau sulit terjadi dengan mempertimbangkan aptamer dan protein di kondisi alaminya tidak rigid dan terus berdinamika. Selain itu, hasil penambatan aptamer N13 dengan FABP3 menunjukkan bahwa region situs pengikatan N13 terletak di residu 1-60 nt, sehingga region 61-90 nt mungkin tidak berperan secara signifikan terhadap afinitas dan spesifisitas aptamer N13. Secara umum, struktur 3D hasil prediksi belum cukup stabil dan konformasi pada panjang simulasi 83 μs menjadi acuan konformasi paling stabil. Hasil simulasi penambatan juga menunjukkan perlunya modifikasi untuk mengoptimalkan afinitas dan spesifisitas aptamer N13 agar potensi pengaplikasiannya sebagai metode deteksi dini penyakit jantung dapat dikembangkan dengan maksimal.

• Tidak tersedia versi lain

• Silakan login dahulu untuk melihat atau memberi komentar.